Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP38Q8NB14 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP38Q8NB14 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms