Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38AQ8NAV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms