Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN19Q8N6F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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