Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf62Q8N4C0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf62Q8N4C0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms