Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RYBPQ8N488 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms