Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PELI3Q8N2H9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms