Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIRREL3Q8IZU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms