Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC105Q8IYK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC105Q8IYK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC105Q8IYK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms