Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHERPQ8IWX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHERPQ8IWX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms