Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRSK2Q8IWQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms