Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms