Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF39Q86UA1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms