Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX20Q7Z614 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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