Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP43Q70EL4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP43Q70EL4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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