Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms