Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms