Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms