Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC129Q6ZRS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC129Q6ZRS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms