Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC73Q6ZRK6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC73Q6ZRK6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms