Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C15orf39Q6ZRI6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C15orf39Q6ZRI6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C15orf39Q6ZRI6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C15orf39Q6ZRI6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C15orf39Q6ZRI6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C15orf39Q6ZRI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms