Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD4Q6W3E5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDPD4Q6W3E5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD4Q6W3E5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms