Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms