Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms