Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA2Q6UW10 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms