Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC4Q6S5L8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC4Q6S5L8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC4Q6S5L8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC4Q6S5L8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC4Q6S5L8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHC4Q6S5L8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC4Q6S5L8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms