Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC8BQ6P9F7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms