Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C22orf39Q6P5X5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C22orf39Q6P5X5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms