Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KANK3Q6NY19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms