Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms