Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEPROQ6NW34 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms