Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD4Q6NW29 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD4Q6NW29 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms