Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD2Q6NTF9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD2Q6NTF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD2Q6NTF9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD2Q6NTF9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD2Q6NTF9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD2Q6NTF9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHBDD2Q6NTF9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms