Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms