Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCTP1Q6DN14 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCTP1Q6DN14 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCTP1Q6DN14 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms