Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNS3Q68CZ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNS3Q68CZ2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNS3Q68CZ2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms