Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP1BQ659C4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms