Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1DP3Q658K8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1DP3Q658K8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms