Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNX4Q63HM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms