Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSHZ3Q63HK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSHZ3Q63HK5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSHZ3Q63HK5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms