Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP9Q5VTM2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms