Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC38Q5VT99 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms