Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms