Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROCCQ5TZA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CROCCQ5TZA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROCCQ5TZA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROCCQ5TZA2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROCCQ5TZA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CROCCQ5TZA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms