Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRTP1Q5TC63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms