Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms