Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5B0

LCE3E, Late cornified envelope protein 3E, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3EQ5T5B0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms