Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDSS1Q5T2R2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDSS1Q5T2R2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms