Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN11Q5T124 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN11Q5T124 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms