Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF3Q5SZQ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF3Q5SZQ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF3Q5SZQ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF3Q5SZQ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF3Q5SZQ8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms