Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms